Głównym celem jest wzmacnianie wizerunku trzeciego sektora, promocja działań najlepszych organizacji, popularyzacja dobrych praktyk oraz upowszechnianie najlepszych pomysłów.
Księgarnia specjalizuje się w komiksach i mandze. W ofercie jest też duży wybór fantastyki, gier planszowych. Duży antykwariat komiksowy i książkowy. W Fankomiksie odbywa się również wiele spotkań autorskich i warsztatów dla dzieci i dorosłych.